Prvi gradonačelnik Grada Mostara izabran na demokratskim izborima je Milivoj Gagro koji je obnašao funkciju gradonačelnika od 14. XII. 1990. godine do ratnih zbivanja 1992. godine.
Za vrijeme ratnih zbivanja gradonačelnici su bili Jadran Topić, Safet Oručević i Mijo Brajković. Od 1996. godine postoje funkcije gradonačelnika i dogradonačelnika a obavljali su ih Ivan Prskalo i Safet Oručević, a nakon njih Neven Tomić i Hamdija Jahić, te Ljubo Bešlić i Hamdija Jahić.
Prvi gradonačelnik nakon ukidanja šest gradskih općina i proglašenja Statuta Grada Mostara je bio Ljubo Bešlić, koji je obnašao drugi uzastopni mandat do 15.02.2021. godine.
Gradonačelnici Grada u različitim oblicima (predsjednik SO, predsjednik vijeća i sl.) kroz povijest su bili: